بیماری های مقعد در انتهایی ترین نقطه دستگاه گوارش بروز می کند. ممکن است این بیماری ها شامل بیماری های عفونی و ویروسی، یا توده هایی مانند هموروئید و شقاق و آبسه و فستول باشد.